據(jù)了解，外界殷殷期待馬英九連任后有更多作為的，是在兩岸相關(guān)議題上，與兩岸關(guān)系有關(guān)的部會(huì)，就可能列入第三波調(diào)整范圍，這包括“陸委會(huì)”、?；鶗?huì)，甚至臺(tái)外事部門與“國防部”等。現(xiàn)在并未思考到“國安會(huì)”的調(diào)整，但“國安會(huì)”人事也有可能到受到行政團(tuán)隊(duì)改組影響，有所變動(dòng)。

黨政人士表示，如果馬英九某些部會(huì)表現(xiàn)與績效沒有特別的問題，就有可能繼續(xù)多做一、兩年，未必一定異動(dòng)。