這是5月30日德國羅伯特?科赫研究所提供的腸出血性大腸桿菌的電子顯微鏡照片。新華社/法新
新華網(wǎng)柏林6月2日電(記者班瑋)中國深圳華大基因研究院和德國漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院2日宣布,由中德科學(xué)家聯(lián)合進(jìn)行基因研究結(jié)果顯示,導(dǎo)致近期德國腸道病感染疫情的是由一種新的兼具侵襲、產(chǎn)毒、腸出血等特征的大腸桿菌。
深圳華大基因研究院發(fā)表的新聞公報(bào)說,在一項(xiàng)由該研究院、德國漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國疾病預(yù)防與控制中心和軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所聯(lián)合進(jìn)行的研究中,研究人員利用第三代測序儀“Ion Torrent”對(duì)在德國流行的病菌進(jìn)行了全基因組測序,并通過對(duì)序列的分析發(fā)現(xiàn)該菌株屬于血清型O104大腸桿菌。但是,O104型大腸桿菌以前未見引起人類大規(guī)模感染的報(bào)道。研究人員通過進(jìn)一步比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)該菌株與2002年從中非艾滋病患者腹瀉標(biāo)本中分離的腸聚集性大腸桿菌55989菌株的同源性超過93%。對(duì)基因序列的分析結(jié)果顯示,導(dǎo)致德國疫情的菌株通過基因水平轉(zhuǎn)移獲得了腸出血性大腸桿菌的毒力基因和毒力相關(guān)質(zhì)粒,這可能與該菌株強(qiáng)毒性和重癥感染有關(guān)。
研究還發(fā)現(xiàn),該菌株攜帶氨基糖甙類、大環(huán)內(nèi)酯類、磺胺類等抗生素的耐藥基因,導(dǎo)致抗生素治療無效。
中國科學(xué)家還將進(jìn)一步分析這些毒力相關(guān)基因的完整性和表達(dá)情況以及耐藥和毒力基因水平轉(zhuǎn)移機(jī)制,并在更多德國流行菌株中進(jìn)行驗(yàn)證。
漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院細(xì)菌專家羅德2日說,這項(xiàng)德中聯(lián)合研究在德國流行的致病菌中發(fā)現(xiàn)了兩種完全不同的細(xì)菌的部分基因。這一新組合有利于病菌在腸細(xì)胞上附著,從而使其能在腸道內(nèi)宿居更長時(shí)間,造成更大的破壞。此外,這種病菌還對(duì)抗生素具有很強(qiáng)的抗藥性。羅德稱這種新型病菌“是常見的腸出血性大腸桿菌的一個(gè)非常遠(yuǎn)的遠(yuǎn)親”。
據(jù)中國深圳華大基因研究院介紹,德國大腸桿菌疫情發(fā)生后,該研究院立即與德方研究機(jī)構(gòu)建立聯(lián)系開展合作,并成立專門研究小組對(duì)該細(xì)菌進(jìn)行測序和生物信息學(xué)分析。在獲得病菌樣本后3天的時(shí)間內(nèi),華大基因就完成了對(duì)這種新型大腸桿菌的基因組測序。
在過去3周多時(shí)間內(nèi),腸出血性大腸桿菌疫情已在德國造成約2000例確診或疑似病例,至少18人死亡。